Le professeur Pinto a obtenu son diplôme à l'école de médecine de l'université de Lisbonne en 1984. Il a effectué son internat en cardiologie à l'hôpital universitaire Santa Maria - CHLN, E.P.E. (Lisbonne, Portugal) et à l'école de médecine de l'université de Stanford (Californie, États-Unis), où il a obtenu une bourse de recherche clinique. Il a ensuite été titulaire clinique au laboratoire d'échocardiographie et a suivi une formation en cardiologie interventionnelle dans le même établissement.
Il est actuellement professeur titulaire de cardiologie, chef du service de cardiologie et du service cardiaque et vasculaire de l'hôpital universitaire Santa Maria, CHULN E.P.E., président sortant de la Fédération mondiale du cœur (FMC) (2021-2022). Récemment, il a également terminé son mandat de doyen de la faculté de médecine de l'université de Lisbonne (Lisbonne, Portugal) (2015-2018)-(2018-2022).
Coordinateur national du Conseil des écoles de médecine (2018-2020) et président du conseil exécutif du Centre médical académique de Lisbonne (CAML) (2019-2021) et directeur de l'Institut cardiovasculaire de Lisbonne (ICVL) depuis 1999.
Il a été président et fondateur de l'Association européenne d'échocardiographie (2002-2004), une branche enregistrée de la Société européenne de cardiologie (ESC), président du CPC (comité du programme du congrès) de l'ESC (2008-2010), président de l'Agence européenne du cœur (2016-2018) et président de l'ESC (2014-2016). Il est président sortant de la Fédération mondiale du cœur (FMC) (2021-2022) et siège au conseil d'administration de l'European Heart for Children.
Il est membre de la Société européenne de cardiologie (FESC), de l'American College of Cardiology (FACC), de l'American Society of Angiology (FASA), de la Society for Cardiac Angiography and Interventions (FSCAI) et de l'American Society of Echocardiography (FASE), ainsi que membre honoraire de plusieurs sociétés internationales, dont la Société française de cardiologie, Sociedad Colombiana de Cardiologia, American Society of Echocardiography, Societá Italiana de Ecografia Cardiovascular, Hungarian Society of Cardiology, Japanese Circulation Society, Sociedad Peruana de Cardiologia, Romanian Academy of Medical Sciences, Romanian Society of Cardiology, Russian Society of Cardiology et Slovakian Society of Cardiology. Nommé par acclamation (29 novembre 2018) membre honoraire de l'Académie nationale de médecine du Brésil. Il est président honoraire du Comité international pour l'éducation et la coopération de la Société italienne des sciences médicales (SISMED). Membre honoraire de la Société brésilienne de cardiologie (nov. 2020) et de la médaille Dante Pazzanese (nov. 2020).
Il a été rédacteur en chef du Journal portugais de cardiologie (1999-2015) et est actuellement rédacteur consultant et membre du comité consultatif et éditorial de plusieurs revues internationales à comité de lecture, ainsi qu'expert-réviseur pour la Commission européenne. Le professeur Pinto a publié plus de 600 articles indexés et a présenté plus de 1 500 conférences/présidences lors de réunions nationales et, pour la plupart, internationales.